Kiemgroente is erg kwetsbaar en maar kort houdbaar. Op kiemgroenten kunnen bacteriën voorkomen, zoals salmonella en E. coli. Het kiemen gebeurt namelijk onder vochtige en warme omstandigheden. De Wereldgezondheidsorganisatie waarschuwt al bijna 10 jaar voor het risico van grootschalige kweek van kiemgroenten. De zaden worden vervuild tijdens het oogsten op het veld, transport of opslag. Kleine hoeveelheden van bijvoorbeeld EHEC kunnen dan al snel uitgroeien tot een ziekmakend niveau. Gezien vermoedelijk de zaden besmet zijn, biedt het zelf thuis laten kiemen van zaden geen garantie op veiligheid.